明朝时期，菲律宾成为吕宋，奉明朝为宗主国。但在1565年，西班牙入侵菲律宾，明朝的不作为让菲律宾沦为西班牙的殖民地，1571年西班牙兴建了马尼拉城。
菲律宾离明朝东南沿海地区虽然有些距离，但那时的航海技术已经相对成熟，因此从东南沿海漂洋过海到菲律宾并非难事，因此，很多东南沿海活不下去的贫民或者商人，都乘船出海去菲律宾讨生活。
华人自古吃苦耐劳，因此到菲律宾定居的华人很快闯出一片天地，但华人富裕引来了西班牙和土人的仇视和不满，凶残成性、劫掠成风的他们想要洗劫华人的财富。恰逢当时明王朝万历帝听到传闻说菲律宾有金矿，派人来探查。
万历皇帝的举动让西班牙人大为紧张，那时候的明王朝虽然在走下坡路，但也是西班牙人招惹不起的庞然大物。为了防止明朝大军打来，当地华人里应外合，西班牙人悍然举起屠刀，对华人进行了惨无人道的屠杀！
那是1603年，西班牙在马尼拉第一次屠华！
在这次屠华事件中，几万名华人只有几百个幸存者活了下来，其他人都成了西班牙人和土人的刀下亡魂，华人辛辛苦苦积攒的财富也便宜了西班牙人和土人。
面对西班牙人的屠杀，明王朝是怎么做的呢？
明王朝认为跑到菲律宾的华人都是背叛朝廷的贱民，不值得朝廷为他们主持正义。于是朝廷只是不痛不痒地给西班牙人颁发了一份《谕吕宋檄》，大概意思就是让西班牙人以后不要这样做了……里面连句强硬的抗议都没有……
明王朝的这种反应让西班牙人更加肆无忌惮，1639年，西班牙人联合当地土人对华人再次发动屠杀，无数华人死于非命。
两次屠杀本该让华人对马尼拉却而远之，但当时明清朝代更迭，天下大乱，无数没有立锥之地的华人在没有选择的情况下还是漂洋过海来到了马尼拉。当然，这也跟西班牙为吸引华人假模假样地给出了优惠政策有关。
又经过几十年的发展，华人再次在马尼拉站稳脚跟，并掌握了马尼拉的大量财富，这时候西班牙人又开始眼红，筹谋策划发起再次屠华。
西班牙的做法让大明的延平郡王郑成功很是愤怒，他派人向菲律宾总督下书，谴责西班牙人对华人的杀戮！甚至表示要带兵攻占菲律宾，为华人报仇！但郑成功的下书反而成为了西班牙第三次屠华的导火索！
原本就筹谋屠华的西班牙人为了避免郑成功来攻时华人响应，就悍然发动了第三次屠华！
面对西班牙人的做法，郑成功勃然大怒，他立即筹备军队，准备进攻马尼拉，但遗憾的是，当时郑军内部发生重大内乱，郑成功不久后去世，导致这次征讨无疾而终。
而郑成功的接任者郑经曾在1670年和1671年两次准备征讨马尼拉，但遗憾的是也未能成行。
