元朝的“儒家化”从忽必烈时期开始大规模拓展，像定国号、太子制、科举制等逐步定型。但是因为忽必烈笃信佛教，以及国内四种文明之间的较量，造成忽必烈既是儒家文化推行的最大动力也是最大阻力。例如佛教与儒家的竞争。
在这方面，大和尚刘子聪（刘秉忠）作为元世祖的股肱之臣深受信任，他为元朝定国号、建大都，对于太子制、科举制地推行有着居功至伟的作用。
但刘秉忠毕竟不是皇帝，作为一名汉臣面对着胜利者的蒙古族、受到重用的色目人，他本身就有固有的弱势。所以，元朝的儒家化从忽必烈到元亡一直都是在路上。
失败下的太子继承制：忽必烈与太子真金
元世祖的嫡长子真金比忽必烈更加儒家化，在汉人幕僚建议下，为了防止地位争夺，元世祖在至元十年（1273年）三月立其为皇太子，选择王恂、李谦、何玮、徐琰等儒臣为官署。因为，真金受汉文化影响颇多，其在治国理念上也多接受儒家治理。为此，真金与忽必烈之间在治国理念上发生严重分歧。
真金与忽必烈近臣阿合马发生严重政策分歧，因为阿合马乃是皇后的陪嫁奴隶，所以，真金在忽必烈面前也敢殴打重臣。但很显然，这对于忽必烈和真金之间的关系也必然会产生不好影响。
1285年，一位南台御史（江南行御史台的官员）上奏：要求忽必烈禅位真金，原因是年龄大了（70周岁），同时要求皇后南必不要后宫干政。
太子真金的姨弟、木华黎的四世孙，中书右丞相安童等人得知后非常害怕，刘秉忠、张文谦等汉大臣推荐的尚文把奏折藏了起来。阿合马的余党们趁机要将太子告倒，在元世祖首肯下搜查奏折。
在此情况下，安童等人在尚文建议下向忽必烈交代了经过，并告发阿合马余党们的所作所为。元世祖大怒，下令彻查。这一事件就是著名的“禅位风波”，因为与父亲关系不睦，真金为此竟然忧心病卒。元世祖死后，支持真金的一方力排众议立真金三子铁穆尔为帝。
四次内战，不仅阻碍了“太子制”的形成，更阻碍了儒家化历程
虽然“太子制”在元世祖时期已经出现，但蒙古传统的继承制度仍然存在着。为何如此？首先就是在元朝这个世界性都市内一直存在着四大文明思想。即佛教、儒家、畏兀尔、蒙古文明。
武仁授受：从皇位继承可以看出：成宗是忽必烈的孙子，无子嗣；第三位皇帝元武宗为真宗之子答剌麻八剌的儿子，也就是成宗的亲侄儿，因为弟弟爱育黎拔力八达在其争位过程中功劳很大，武宗竟封其弟为皇太子，兄弟二人：兄终弟及、叔侄相传。
南坡之变：仁宗死后将帝位并没有传给武宗的儿子，而是传给了自己的儿子。1316年，硕德八剌被立为皇太子。1323年，一直推行儒化的英宗，被权臣铁木迭儿的义子铁失在南坡店刺杀（南坡之变）。
两都之战：铁失杀死英宗后，立刻北上将玉玺交给晋王也孙铁木儿，其后晋王称帝、其子为皇太子。
1328年泰定帝驾崩后，燕帖木儿便以奉武宗遗诏为名，立武宗次子为帝是为文宗、也孙铁木儿的儿子阿速吉八则在上都称帝，双方爆发“两都之战”，一个月后文宗胜利。
文宗继位后，因为笃信儒家，所以在当了四个多月的皇位后便禅位给兄长是为明宗。但明宗登基后不久（封文宗为皇太子），却在与文宗相聚后的第四天暴亡。文宗再次继位，1329年，立嫡长子阿忒纳答剌为皇太子，次年竟夭折。
1332年去世时，孩子们中也仅有次子活着，因为年幼才6岁，文宗怕其后不得善终，希望立明宗长子妥懽帖睦尔为帝，那时妥欢帖睦尔已经12周岁了，也算是对当年的所作所为的一种补偿。
哪知权臣燕铁木儿却立了明宗的次子懿璘质班为帝，在位不足两个月就暴亡。
父子内战：燕铁木儿没有办法只好立了元惠宗，元惠宗也按照汉制立了太子爱猷识理达腊，但在奇皇后鼓噪下，元惠宗与太子之间在农民起义烽烟滚滚中却仍然在1363年到1365年打起了“父子内战”，孛罗帖木儿和扩廓帖木儿（王保保，他只不过取了个汉化名字，实际仍是蒙古族，朱元璋称其为“天下奇男子”）两个大军阀之间的混战。
大军阀之间的战争，又引来元朝大军阀下的各地军阀之间、小军阀与大军阀之间的战争。
儒家化在内战中，迎来了灭亡：大元变成北元
这种内战直到徐达大军攻入大都、元惠宗父子北逃之后才开始消停。父子二人这才开始和缓，爱猷识理达腊也才与王保保间不再争斗。原来，1365年七月，元惠宗在杀了大军阀、曾经的拥护者孛罗帖木儿后，请太子回大都。九月，王保保即将与太子到京时，接到奇皇后命令，要求王保保胁迫惠宗让位。
王保保听闻，在离城三十多里时拒绝大军跟随太子进城，由此反目成仇。在农民起义压力下，王保保守住自己的老巢彰德（河南安阳）自保。无奈之下，惠宗于1367年八月任命太子为“天下兵马大元帅”，而他却派兵进攻王保保。
总之，元朝内部直接到灭亡前仍然在争斗，斗来斗去直到全部被打败。当然，元朝的内斗被宋朝、明朝内斗还强些，宋朝、明朝属于内斗到死，元朝到死前终于知道团结了。
岭北之战的胜利就是王保保和元昭宗（爱猷识理达腊）团结的结果，但那时元朝已经不复存在，只剩下北元这一政权，当然“北元”是后人定的，打的旗号还是元。但打什么旗号不重要，重要的是本质。
