所谓三韩中的百济在当时的各方势力中算是最特别的一个，在当时，百济的实力要弱于强悍的高句丽，但强于更加弱小的新罗，差点将新罗抹去，只不过新罗引来了唐朝才得以反击成功。而三者之中，百济与东边的日本关系不错，彼此之间的联系也相对紧密，古代日本很多来自中原的文化，都是经百济之手才进入日本列岛。
日本列岛孤悬海外，在古代相对于陆地与中土相连的朝鲜半岛，其文明发展程度长期都很滞后，直到日本大化改新之前，都长久处于奴隶时期。而百济吸收了大量中原的先进文明，已经成为当时在东北亚比较强盛的海上强邦。强弱实力对比之下，日本自然对百济也是非常尊敬，日本学习中原文明，最早就是通过百济得以进行的。
日本并没有文字之类，汉字也通过百济传入了日本，在半岛之上，百济的地理位置最接近日本的西部地区，同时文化与经济也最是繁荣。日本与百济交好，也是出于学习与崇拜先进文明的体现，从百济那里日本得了很多的好处。对百济来说，日本非常恭顺，而对日本来说百济使得自身发展迅速，双方都有好处。
不过随着日本羽翼渐丰，双方之间的关系也出现了比较深刻的变化，由于中原隋朝时期，日本遣隋使带回了比百济更加先进的文化与其他制度，使得日本文明发展突飞猛进，而且整体来说，日本终究无论在面积还是人口等方面，都要强于百济。所谓教会徒弟饿倒师傅，日本强起来之后，百济就开始受到了日本的欺负。
日本兴盛起来之后，曾在半岛南端建立了所谓的“任那”进行直接的管理统治，并且迫使百济将王子送去日本作为质子。比如著名的白江口之战前，日本曾送百济王子回国，没多久就发生了白江口大战。可以说，在历史的后半段，百济与日本之间的关系与前期是颠倒过来的，以日本为尊而以百济为卑。
百济建立在半岛的南端，在高句丽衰落之后也曾兴盛一时，其辖制的范围甚至一度包括了整个半岛的西部海岸，是当时东北亚相当强盛的国家。只不过在唐朝灭了高句丽之后，百济有意吞了新罗，甚至看错了态势，与日本相勾结欲与唐王朝为敌，最终却弄巧成拙，导致了百济王国的直接灭亡，大量百济遗民前往中原与日本。
可以说，百济与日本的所谓友好关系并不是真正的友好，只是因为不同时期一方强而另一方弱所形成了利益关系而已。在双方进行交流的前期，比较落后的日本为从百济那里学习先进文化，获得更多的利益而与之交好，而后期日本实力增强，夹在唐朝与日本中间的百济，错判情况选择了站日本一边与之联盟最终导致国家覆亡。
