张居正不是不想重用海瑞，而是不敢！
海瑞做到了右佥都御史，正四品，再往上升就遇到天花板了。这个天花板就是张居正。当所有人都强烈举荐海瑞时，张居正还是一票否决了。
张居正否决海瑞的原因，《明史》解释得很清楚：“惮瑞峭直”。海瑞太过严峻刚正了，他认定的事一定要做，连天王老子都无法阻止。对此，张居正是心有所虑的。
张居正的忧虑在他给海瑞的信中也说得很清楚，“三尺之法不行于久矣。公聚而矫以绳墨，宜其不堪也。讹言沸腾，听者惶恐。仆谬忝均轴，得参与庙堂之末议，而不能为朝廷奖奉法之臣，摧浮淫之议，有深愧焉。 ”（《张居正书牍》）
海瑞出任南直隶巡抚时，在处理当地的土地兼并严重问题上，首先从徐阶开刀，继而全面铺开，触动了很多官僚缙绅的利益。海瑞成为众矢之的，也因此被参劾，最终被迫辞官回乡。
两年后，万历皇帝登基，张居正出任首辅。海瑞希望得到张居正的支持。张居正也非常讨厌苏松，也就是苏州府和松江府辖内的地主。但他在给海瑞的回信中还是表明了自己的观点。
国家法律在你那早就不行了，你突然严打，恐怕不妥。很多人都在造你的谣，听众惶恐不安。我虽然身居国家要职，只能在朝堂上为你说句话，不能替朝廷给您发金牌，赶走那些苍蝇一样的议论，深感愧疚啊！
张居正表面同情海瑞实则责备他的做法激进轻率。海瑞是到应天推行“一条鞭法”的，按理说应该能全权得到上面的支持，但张居正还是对其做法有所责备。
也有说法认为，当海瑞拿徐阶开刀时，徐阶长子来找张居正求情。徐阶曾经眷顾提拔张居正，这点情面还是要给的。张居正于是给海瑞说情递条子，可以海瑞全然不予理会。
在海瑞看来，法就是法，情就是情，更何况徐阶曾经救过海瑞，对救命恩人尚且如此，更不要说上级的说情了。在法面前，知恩图报的事情只能压一压了。
事实上，张居正和海瑞都积极求变，提倡知行合一，经世致用，但在改革一事上，一个务实求变，一个理想而不知变通。
这个分歧点主要体现在对“祖宗之法”的态度上。
海瑞力图恢复洪武皇帝拟定的制度。比如，他复出不久，就向万历上疏，“举太祖法剥皮囊草及洪武三十年定律枉法八十贯论绞”，要求酷法治贪，引得朝廷非议颇多。海瑞的思想说得好听点，就是“以身为障，回既倒之狂澜”；说得不好听就是复古。
张居正虽然明面上也拿出了“祖宗之法”的招牌，一再强调他是在恢复“祖制”，但实际上这是推动变法的理论依据和斗争工具，以此减少朝廷的阻力。所以，在对待“祖宗之法”上，张居正则比较灵活，需要时候就用，不需要时就讲变法的那一套。
对比来看，海瑞就是“一根筋”了。
海瑞是朝廷树立起来的道德楷模，凡事按照一个准则往前冲就是了，哪怕“尸谏”也在所不惜；而张居正是经世致用的宰辅之才，他要考虑的东西比较多，自然不能用海瑞那一套来办事。
须知，在体制内办事求不得完美、100分，意思到也就可以了，所谓“水至清则无鱼”就是这个道理，况且张居正本人道德上也有瑕疵。张居正和海瑞的分歧是可以理解的。
电视剧《大明王朝》里，张居正曾经说过，海瑞就是一把剑，一把国之利剑，要想扳倒严党必须要海瑞出山。
现在严党倒台了，到了张居正这里，海瑞依旧是一把剑，需要的时候可以披荆斩棘，扫除改革上的障碍。但这把剑太过锋利，如果举得太高，则容易伤到自己，也容易伤及大众。这或许就是张居正不重用海瑞的真正原因。
